La sede de esta Real Academia se encuentra desde 2006 en el palacio de Alcántara, sito en la calle Emilio Castelar nº45 de Écija.
Durante dos décadas, entre 1986 y 2006, la sede de la Real Academia estuvo en el palacio de Peñaflor.
Según consta en los archivos de la Corporación, en el Pleno celebrado el día 5 de marzo de 1986, siendo Presidente el Ilmo. Sr. D. Antonio Fernández Pro, uno de los puntos del orden del día tratados se refería a la sede de la Academia:
"El Presidente informa ampliamente de las gestiones llevadas a cabo con el Ayuntamiento, para la consecución de la misma, que ha sido fijada provisionalmente en las dependencias del Torreón Noble del Palacio de Peñaflor, tomando posesión del mismo con dotación de mesa y armario-archivo. A este acto de posesión asistieron con el Presidente de la Real Academia, los Académicos Numerarios Ilmos. Sres. D. José Nogueras Ternero y D. Vicente Durán Recio, que fueron recibidos a las puertas del Palacio por la Delegada de Cultura, Dña. María Luz Ménez Correa y el Delegado de Turismo, Sr. Luna Riel".